Pajusirkkuja jää joka talvi etelä- ja lounaisrannikon ruovikoihin talvehtimaan.
Alueella pajusirkku on havaittu talvikaudella vain kuusi kertaa. Näistä neljä havaintoa on tehty joulukuussa Tuusulanjärvellä, Kytäjärvellä ja Mäntsälän Kaukalammella. Molemmat tammikuiset havainnot ovat vuodelta 1977 ja ne on tehty Keravalla Sompion-Kanniston alueella.